话说五百年前，紫霞仙子私下凡尘，邂逅妖猴孙悟空，展开了一段凄绝美绝的旷世奇情。不想妖仙之恋为天道所不容，天庭为了维护神仙至高无上的尊严宣布要荡平魔界，而孙悟空因紫霞仙子之死而疯狂，率领群妖对抗天庭。人类为求自保，或投身于两方之一，或自成一伍，一场人、仙、魔三界混战就此拉开帷幕。三界间战火屠天，秩序不复存在。战争终以天界击败孙悟空而终，令其堕入轮回思过。
时至大唐贞观年间。三界大战已平息五百余载，世间重又恢复了安宁与繁荣。当世分为四大部洲，众生善恶不一。东胜神洲居生奇兽灵仙，汲日月精华，敬天地礼法，心爽气平；北俱芦洲为蛮族所踞，多生凶禽猛兽，异常凶险；西牛贺洲多隐仙庭道馆，习阴阳之术，养气潜灵人人固寿；而南瞻部洲独为人世红尘之所，亦为人、魔、仙三族混居之地。
天地间芸芸众生分为人、仙、魔三大种族，各族天赋不同，自有所长。
超脱而飘逸的仙族能够掌握天地之灵气，并能将他们转化成为百变神通；从阴暗中走出的魔族崇武好杀，他们也往往拥有超强的战斗力和抵抗力；看似平凡的人类在战火中习得阴阳五行之理，演化为玄妙的法术和武学。并尝试挖掘自己强大的心灵力量，立身于三界之间。三族均各自创立六大门派，以广纳门徒，传授技艺，壮大声威。
然而事实的背后，却隐藏了一个惊天大秘密，紫霞仙子与妖猴孙悟空的相遇，相爱，到紫霞仙子之死，全部都是人为设计，并且在背后推波助澜，而幕后黑手就是蚩尤，目的就是挑起两族大战，让三界生灵涂炭，戾气横生，而戾气则是蚩尤的力量来源，戾气越大越重，蚩尤的实力就越强。
奈何蚩尤忽略了弱小的人族，人族的崛起，打破了蚩尤的原本的计划，在人族势力的帮助下，濒临灭绝的魔族得以喘息，经过人族从中协调，最终三方缔结盟约，从此和平共处，互不干涉。
而羽灵神之所以痛恨人族，就是因为他的家乡梧桐仙居，当时魔族得到人族的帮助下，在梧桐仙居地界与仙族展开了七天七夜的大战，羽灵神所在的家族，大部分的人都丧命于此，更严重的是，当时魔族连连败退，激进的魔族中，有一名大能不惜以生命献祭，发动上古秘法，毁掉了整个梧桐仙居。
而如今的门派闯关，其实也是为了加强三族之间的关系，挑战队伍中，常常出现同时拥有人仙魔三族成员，大家相敬如宾，关系融洽。
但是危机也在逐渐靠近，从十二魔神强良的出现，再到四大魔将穷奇的登场，种种迹象都表明，伴随着邪恶的蚩尤旧部逐一浮出水面，一场空前绝后的大危机正在酝酿中，没有人知道什么时候会突然爆发，又会发展到哪种程度，又有多少人会因此丧命。
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