当整个天翻教的气氛越来越疯狂的时候，吴神医却开始反思自己的所作所为。
吴神医自己在书中说，当有一天，他仔细审视自己的试验品之时，他在一个试验品的眼睛里看到了眼泪，他就突然意识到自己的所作所为是多么的人性泯灭。无论这些试验品是不是罪大恶极，吴神医知道自己已经是罪大恶极。
吴神医虽然感到自己罪大恶极，却还不想自我了断，吴神医认为自己在死之前，还能做一些正确的事情，比如说为自己这些试验品找到治疗的方法。
吴神医调整自己的研究工作中重心到治疗上之后，天翻教的人对吴神医生出了怀疑。在他们怀疑之中，吴神医想要逃出天翻教。
吴神医原本没有任何出逃的希望，但他想到一个可能会同样想要逃出天翻教的顶尖武者。
这个武者就是当年给吴神医讲了很多关于道德理论的武者。这个武者的名字，吴神医在书中没有提到，却一直用神经病来称呼他。吴神医说大概只有神经病才能这么固执。这个神经病自始至终一直在给吴神医送试验品，他送来的试验品都是罪大恶极之人，每次送来试验品都要对吴神医说明他们的罪行，并且要求亲眼看着吴神医对他们下药。
到了后来，吴神医对神经病说：“现在我的试验并不是非常需要你送来的这些人。你送来的这些人都是罪大恶极之人，但同时也都是成名许久的武林人士。这些人修炼内力已久，身体已经发生了一些变化，在做试验的时候，总会有一些影响，让我不能准确的观测。我现在更喜欢那些还没有修炼出内力的武者作我的试验品。”
神经病说：“可惜，这些武者都不可能是罪大恶极之人。”
吴神医说：“可是这些人也有机会成为罪大恶极之人。你如果能提前把他们抓来，让他们根本就没有成长为罪大恶极之人的机会，岂不是更好？”
神经病说：“你知道哪些人将来一定会成为罪大恶极之人吗？”
吴神医说：“虽然不能肯定地说哪一个人会成为罪大恶极之人，但可以肯定地说哪一类人可能会成为罪大恶极之人的可能性非常高。如果你尽早的消灭这一类人，实际上是在为天下做好事。”
神经病说：“谢谢你的建议。你的建议说起来也是正确的。但是你的这个建议还是就停留在只是一个建议好了，因为你的这个建议一旦实行起来一定会成为最糟糕的事情。”
吴神医说：“当然，如果有人在这个天下间，有组织地实行我这个建议，那一定会弄得天下大乱。但是如果你自己一个人，在为我抓那些还没修炼出内力的武者回来做实验时候，想着我的那个建议，在抓他们的时候，会更加心安理得。”
神经病说：“还是算了。无论如何，我都不会对那些还没有做出罪大恶极恶行的人动手的。即使我知道，他们已经计划了罪大恶极的恶行，并且打算明天就要实施，虽然我会尽力阻止他，但我也不会因此在今天就让他接受死亡的惩罚。”
吴神医说：“没想到，你还是一个这么有原则的人。”
神经病说：“我这人剩下的原则不多了，差不多就这么一个原则了。你知道原则的作用吗？”
吴神医说：“不知道。”
神经病说：“我们说到原则的时候，常常惯用的说法是做人的原则。原则的作用，在我看来，就是维持人的灵魂的稳定。原则过多，灵魂受到束缚。原则越少，灵魂越是自由。但要是没有原则，灵魂则消散无形。只有当原则不多不少之时，灵魂才会既有自由，又有稳定，处在一个最完美的状态。我这人，原则太少，我灵魂的稳定全靠这一个原则维系。如果我连这个原则也抛了，我就彻底没灵魂了。吴神医，你难道没有感到自己的灵魂快消散了吗？你做事可是越来越没原则了。”
吴神医说：“什么灵魂，我是不信灵魂的，我解剖过这么多人，从来没见过里面有灵魂。在我看来，我们都是高档的机关人。你这种依赖灵魂存在的人，在我看来都是不能直面真相的懦夫。真正的勇敢者，会承认灵魂是不存在的，我们只是血肉做成的机关人这样一个真相。”
神经病说：“我做不了这样的勇敢者，就让我做一个躲在灵魂幻想后面的懦夫吧。”
吴神医说：“去吧，你以后可以不再给我送试验品了。”
神经病走了，但神经病又来给吴神医送试验品了，送来的还是罪大恶极的武者。
吴神医说：“这些人对我来说真的是没什么大用处。”
神经病说：“我知道，你给我说的很清楚了。我只是想看着这些人遭受惩罚。”
吴神医说：“你直接杀了他们，或者把他们凌迟，放油锅，不都是可以吗？”
神经病说：“无论我做什么，我只是在惩罚他们的肉体，我杀死他们的肉体的时候，他们的灵魂却没有受到相应的惩罚。”
吴神医说：“那把他们交给我，就能惩罚到他们的灵魂？”
神经病说：“我认为是可以的。我仔细观察过你的这些一号试验品，虽然他们只会吃喝拉撒，但透过他们的眼睛，我分明看到他们的灵魂还活着，被困在躯体里，遭受煎熬。所以，我请求你，无论你是否需要这些试验品，请对他们下药，给他们的灵魂宣判无期徒刑。”
吴神医答应了神经病的请求。在那之后，吴神医也常常观察这些试验品的眼睛，但总是告诉自己那个神经病一定是看错了，他看到的灵魂只是一个可笑的自我安慰。
直到那一天，吴神医在一个试验品的眼睛里看到了眼泪。吴神医虽然还是不怎么信灵魂的存在，但他却想到，这些试验品或许还是有意识存在的，知道自己正遭受的事情。
吴神医这才意识自己行为的罪恶。当吴神医想要逃走的时候，他想到了神经病。
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